Sự nghiệp sớm

Lucas Paquetá đến Flamengo năm 2007 khi mới chỉ 10 tuổi. Ở tuổi 15, Paquetá rất giỏi về kỹ thuật nhưng thể chất lại thua kém so với các cầu thủ khác đồng trang lứa. Tuy nhiên, đến năm 18 tuổi, chiều cao của anh đã tăng vượt trội. Tại đội trẻ Flamengo, Paquetá đã giành được danh hiệu Copa São Paulo de Júniores 2016, giải đấu trẻ quan trọng nhất dành cho lứa tuổi dưới 21 ở Brazil. Bên cạnh các cầu thủ nổi bật khác Léo Duarte, Felipe Vizeu và Ronaldo da Silva Souza, Lucas đã được đôn lên đội hình một của câu lạc bộ ngay sau giải đấu đó.[1]

Flamengo

Tháng 3 năm 2016, anh ký hợp đồng chuyên nghiệp với Flamengo với thời hạn đến năm 2020.[2] Trận đấu mở màn của anh vào ngày 5 tháng 3 trong chiến thắng 3-1 của Flamengo trước Bangu tại Giải đấu bang Rio de Janeiro 2016.[3] Paquetá có bàn thắng đầu tiên vào ngày 19 tháng 2 năm 2017 trong chiến thắng 4-0 trước Madureira tại sân vận động Raulino de Oliveira ở Volta Redonda.

Anh cũng ghi bàn thắng duy nhất trong hai trận hòa 1-1 với Cruzeiro tại Sân vận động Maracanã trong khuôn khổ Copa do Brasil 2017, và trong trận hòa lượt về với Club Atlético Independiente tại Copa Sudamericana 2017. Kết quả chung cuộc của cả hai trận đấu, Flamego đều thua và dành vị trí Á quân. Trong trận chung kết Copa Sudamericana, Paquetá được bầu là cầu thủ Flamengo hay nhất trận. Kết thúc năm 2017, anh cùng với Juan được đánh giá là những điểm nhấn của Flamengo. Campeonato Carioca 2018, Paquetá được bình chọn là cầu thủ cánh trái hay nhất giải, và cũng là cầu thủ duy nhất của Flamengo được bầu vào đội hình xuất sắc nhất giải.

Milan

Vào ngày 10 tháng 10 năm 2018, các hãng tin khắp Brasil đã thông báo về việc Milan đã đạt thỏa thuận trị giá 35 triệu Euro với Flamengo về việc chiêu mộ Paquetá trước sự cạnh tranh gay gắt của Paris Saint-Germain.[4] Vào ngày 4 tháng 1 năm 2019, việc chuyển nhượng đã chính thức hoàn tất với việc Milan thông báo về bản hợp đồng có thời hạn 5 năm.[5][6][7] Với việc mẹ anh là người gốc Bồ Đào Nha nên Paquetá đủ điều kiện đăng ký suất cầu thủ châu Âu.[8] Paquetá ra mắt câu lạc bộ vào ngày 12 tháng 1 năm 2019 trong trận gặp Sampdoria tại vòng 16 đội Coppa Italia, anh thi đấu 85 phút trước khi bị thay ra bởi Fabio Borini. Tại trận đấu đó, Milan đã giành chiến thắng với tỉ số 2-0 sau hiệp phụ.[9][10] Bốn ngày sau, anh tiếp tục được chơi trong trận Siêu cúp bóng đá Ý 2018, tại sân vận động King Abdullah Sports City ở Jeddah, Ả Rập Xê Út,[11] nơi Juventus đánh bại Milan với tỷ số 1-0. Vào ngày 21 tháng 1 năm 2019, Paquetá có lần đầu tiên thi đấu tại Serie A trong chiến thắng 2-0 trước Genoa tại Sân vận động Luigi Ferraris. Paquetá đã ghi bàn thắng đầu tiên cho Milan trong chiến thắng 3-0 trước Cagliari, đó là bàn thắng nâng tỉ số lên 2-0. Paquetá dành bàn thắng đó cho các cầu thủ trẻ của Flamengo đã thiệt mạng trong trận hỏa hoạn ngày 8 tháng 2, tất cả chỉ là các cầu thủ dưới 15 tuổi.[12]